Viêm não tự miễn là bệnh lý nguy hiểm, dễ bị nhầm với rối loạn tâm thần do khởi phát bằng các biểu hiện như lo âu, ảo giác, thay đổi tính cách. Phát hiện sớm, điều trị đúng và theo dõi lâu dài là yếu tố quyết định khả năng hồi phục và giảm nguy cơ tái phát.